深圳大学学报理工版 /oa 莱茵衣藻对MeJA处理的初期响应模式分析 /oa/darticle.aspx?type=view&id=202203001 茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)是植物次生代谢的调节剂,参与异戊二烯代谢调控,对莱茵衣藻的异戊二烯类物质合成有重要影响.为探究莱茵衣藻如何快速响应MeJA处理,测定MeJA处理下莱茵衣藻的生长状态和光合效率等生理特征参数,重点关注MeJA处理24 h内2-C-甲基-D-赤藓糖醇-4-磷酸(2-C-methnatureyl-D-rythritol-4-phosphate,MEP)合成途径、类胡萝卜素合成途径和甾醇合成途径关键基因的表达水平变化.结果表明,MeJA处理降低了莱茵衣藻的生物量积累和光合活性,上调了MEP通路和甾醇合成通路相关基因,下调了类胡萝卜素合成途径的关键基因.在转录与生理层面,莱茵衣藻对于MeJA处理的初期响应具有快速与剂量依赖性的特点.研究结果为探索微藻类异戊二烯合成和代谢机制提供理论参考. 2022年05月16 00:00 2022年第3期 237 244 1077284 贾彬,兰成湘,李翔宇 两株海南红树植物内生真菌的生物活性成分 /oa/darticle.aspx?type=view&id=202203002 红树植物内生真菌是新型天然产物先导药物的重要来源之一.为获得具有新颖结构的化合物,对两株红树内生真菌Phomopsis sp. DHS11和Aspergillus fumigatus JRJ111048的代谢产物进行研究.综合利用正/反相硅胶柱、Sephadex LH20凝胶柱和HPLC高效液相色谱法,从发酵提取物中分离得到9种化合物,分别记为化合物1~9.利用高分辨电喷雾质谱(high resolution electrospray ionization mass spectroscopy, HRESIMS)、核磁共振波谱(nuclear magnetic resonance spectroscopy, NMR)、旋光、紫外和红外光谱等技术,鉴定化合物1~9依次为 norpestaphthalide C(1)、norpestaphthalide A(2-a)、norpestaphthalide B(2-b)、7-hydroxy-3-(2-hydroxy-propyl)-5-methyl-isochromen-1-one (3)、alternaroside B (4)、细胞松驰素B (5)、啤酒甾醇(6)、5-羟甲基糠醛(7)、N-(4-羟基苯乙基)-乙酰胺(8)和3,5-dihydroxybenzoic acid (9).其中,化合物1为首次发现的新型苯并呋喃酮类化合物,化合物4是首次从Phomopsis sp.属真菌中分离得到的脑苷脂类化合物.对化合物1~9进行体外免疫抑制、抗肿瘤和抗老年痴呆活性评价,结果表明,细胞松弛素类化合物5具有良好的免疫抑制活性.研究结果为深入挖掘红树植物内生真菌新型生物活性物质提供了参考. 2022年05月16 00:00 2022年第3期 245 252 595378 陈必婷<sup>1,2</sup>,吴炜城<sup>2</sup>,周董董<sup>1</sup>,邓小林<sup>1</sup>,张世清<sup>2</sup>,袁靖喆<sup>2</sup>,徐静<sup>1</sup>,郭志凯<sup>2,3</sup> 消化系统多种癌变组织中3种蛋白质的表达谱 /oa/darticle.aspx?type=view&id=202203003 在口腔、食管和结直肠癌病灶中,TATA序列结合蛋白相关因子1(TATA-box binding protein associated factor 1 like,TAF1L)、stomatin家族蛋白1(stomatin-like protein 1, STOML1)和stomatin家族蛋白2(stomatin-like protein 2, STOML2)存在异常表达.为探究它们在消化系统癌变过程中的作用机理,利用6种消化道肿瘤(食道、胃、结肠、直肠、肝脏和胰腺)及癌旁组织的微陈列芯片,通过多重免疫组织化学染色,比对分析TAF1L、STOML1和STOML2这3种蛋白质在癌与癌旁组织的差异表达及与癌变的关联.结果发现,STOML2在食道、胃、结肠、直肠、肝脏和胰腺这6种消化系统癌组织中均呈显著性高表达(P&lt;0.001),而同一家族成员STOML1则仅在食管癌和肝癌组织中表达明显增高(P&lt;0.005).另外,除胰腺癌灶外,TAF1L在其余5种消化系统癌组织中也呈现高表达(P&lt;0.005).同时,TAF1L、STOML1和STOML2这3种蛋白质均与上皮间充质转化的关键蛋白质MMP9有共定位现象.由此表明,3种蛋白质TAF1L、STOML1和STOML2在多种癌组织中可能具有广泛的促癌作用.由于3种蛋白质在多种癌组织的表达水平不同,说明它们各自存在着组织特异性,且具有不同的功能使命,需进一步研究TAF1L、STOML1和STOML2这3种蛋白质在消化系统恶性肿瘤发生发展过程中各自的分子病理学潜能,如能将它们打造成用于精准诊疗和预后判断的新型分子标志物,此研究结果将有重要的临床意义. 2022年05月16 00:00 2022年第3期 253 261 15094879 王玳玮<sup>1</sup>,王筠<sup>1</sup>,赵宋礼<sup>2</sup>,曾健<sup>1</sup>,胡铭慧<sup>1</sup>,许特<sup>1</sup>,江波涛<sup>1,3</sup>,董蕾<sup>3</sup>,盛司潼<sup>1</sup> 糖尿病鼠骨骼肌萎缩相关环状RNA的研究 /oa/darticle.aspx?type=view&id=202203004 骨骼肌萎缩是糖尿病患者中、晚期严重并发症之一,为研究其分子发病机制,利用链脲佐菌素诱导构建小鼠1型糖尿病模型,通过高通量测序技术,调查与糖尿病肌萎缩病变相关的环状核糖核酸(circular ribonucleic acid, circRNA)表达谱,并利用生物信息分析软件探究circRNA在糖尿病骨骼肌萎缩病变中的可能作用.结果显示,与正常同基因背景小鼠的同类组织相比,糖尿病鼠的腓肠肌呈现:① 肌纤维面积明显减小,运动功能下降;② 含有1 403个与1型糖尿病发生发展相关的差异表达circRNA,其中,690个上调和713个下调;③ 通过基因本体、京都基因和基因组百科全书的功能富集分析显示,差异表达的候选circRNA亲本基因主要富集于转录调节生物学过程、细胞质成分和蛋白质结合分子功能等方面,以及促分裂原活化蛋白激酶信号通路、泛素介导的蛋白降解、叉头盒蛋白O通路与糖尿病肌萎缩相关的信号通路等.通过数据库信息和生物信息分析技术,预测与肌萎缩基因MuRF1相结合的小RNA(mirco RNA,miRNA),并挖掘出可调控它们表达的功能circRNA,构建了circRNA-miRNA-mRNA的潜在分子调控反应轴和互作网络.研究结果表明,与肌萎缩相关的circRNA在糖尿病发病中具有调控关键分子的潜能. 2022年05月16 00:00 2022年第3期 262 270 1600717 杨雷<sup>1</sup>,王筠<sup>1</sup>,邓芳<sup>1</sup>,许特<sup>1</sup>,苟德明<sup>1</sup>,周威<sup>1</sup>,胡章立<sup>1</sup>,邹湘辉<sup>2</sup> 海底隧道纵坡变化对驾驶人脑电信号影响分析 /oa/darticle.aspx?type=view&id=202203005 为明确海底隧道纵坡坡度变化对驾驶人脑电信号的影响,通过开展实车实验,运用脑电仪、坡度记录仪及录像机等设备,采集车辆通过海底隧道变坡区时,驾驶人的脑电信号及海底隧道纵坡坡度数据.选取脑电信号功率谱与脑电功率为参量,分析驾驶人经过海底隧道变坡区时脑电信号活跃水平的变化规律;按照不同上下坡对变坡区进行分组,分别建立海底隧道纵坡坡度变化与脑电信号β波功率变化的数学模型.结果表明,驾驶人在经过变坡区时,大脑活跃水平明显提升,额叶区是对纵坡坡度变化最敏感的脑区;纵坡坡度变化与驾驶人脑电信号β波功率变化正相关,纵坡坡度变化越小,脑电信号β波功率变化越小,驾驶人心理压力越小,行车安全性越好. 2022年05月16 00:00 2022年第3期 271 277 1640701 杨永正<sup>1</sup>, 潘福全<sup>1</sup>, 王召强<sup>2</sup>, 张丽霞<sup>1</sup>, 杨金顺<sup>1</sup> 基于多模态生理信号的驾驶人脑力负荷评估 /oa/darticle.aspx?type=view&id=202203006 准确评估驾驶人脑力负荷状态对降低因驾驶人脑力负荷过载导致的交通事故具有重要意义.基于典型驾驶场景,结合N-back认知负荷次任务,设计不同难度的驾驶任务实验,以研究驾驶人脑力负荷.实验收集驾驶人在任务完成过程中的多种模态生理信号(包括脑电、心电和皮电信号)及美国航空航天局任务负荷指数量表主观脑力负荷数据,提出基于多模态生理信号特征分析和模式识别的驾驶人脑力负荷分类模型,并比较了不同模态生理信号及其组合在三种典型机器学习算法(随机森林、决策树和K最近邻模型)中的脑力负荷分类识别效果.研究表明,基于不同模态生理信号组合的脑力负荷分类模型具有不同的分类准确率.单一模态生理信号的分类模型中,基于皮电、心电和脑电信号的分类模型准确率依次增加.基于多模态生理信号的分类模型准确率普遍优于单一模态分类模型.基于脑电、心电及皮电三模态生理信号的随机森林分类模型具有最高的分类准确率. 2022年05月16 00:00 2022年第3期 278 286 634567 张奇良,杨坤华,曲行达,陶达 城际轨道交通可达性与城市经济发展的关系分析 /oa/darticle.aspx?type=view&id=202203007 城际轨道作为区域交通的骨干,对引导和带动粤港澳大湾区经济一体化发展发挥重要作用.研究并分析了衡量城际轨道交通和经济发展水平的变量,提出城际轨道交通可达性和经济发展水平的测算方法,构建耦合协调度模型,定量评价城际轨道交通可达性与经济发展水平之间的相关性.运用双重差分模型验证城际轨道线路开通与城市经济发展之间的影响关系.以粤港澳大湾区11座城市为例,进一步研究不同年份城际轨道交通可达性对城市经济的影响.结果表明,城际轨道的开通运营对城市经济具有显著正效益,其弹性系数为0.012 8.交通与经济发展越协调的城市,城际铁路开通带来的正向影响越明显.本方法可为区域整体协调发展提供理论与实践指导. 2022年05月16 00:00 2022年第3期 287 295 798931 胡明伟,吴雯琳,赵千,何国庆 基于辐射范围的城市轨道站点可达性研究 /oa/darticle.aspx?type=view&id=202203008 可达性是评价交通基础设施效率的重要指标,准确测算轨道站点可达性有助于进一步优化站点服务设施和接驳环境. 从城市轨道站点可达性的定义出发,建立轨道站点接驳方式选择的多项logit模型,并确定各类型站点对不同接驳方式的辐射范围. 考虑轨道站点周边的建成环境和出行成本,建立基于辐射范围的轨道站点可达性模型. 以中国西安市为例,计算轨道站点步行、自行车和公交接驳的可达性以及站点可达性. 结果表明,轨道站点可达性在空间上呈现出从中心位置到外围“圈层”式递减的形态.换乘站各接驳方式的可达性值均处于较高水平,始末站处于较低水平. 中间站根据位置的不同,可达性存在差异,越接近始末站可达性越低,越接近换乘站和市中心可达性越高. 2022年05月16 00:00 2022年第3期 296 304 984263 马书红,唐大川,李逍,孙杏芳 苜蓿叶立交集散车道连续入出口最小间距研究 /oa/darticle.aspx?type=view&id=202203009 《公路路线设计规范》(JTG D20—2017)中对互通式立体交叉同侧入口与下游出口(简称连续入出口)之间的间距尚未规定,当连续入出口距离较小时,交织车流相互影响,不仅降低通行能力,还会影响区域交通安全.本文选择苜蓿叶立交主线设置集散车道的情况,通过分析此区域车辆运行特性,确定连续入出口最小间距的计算模型.根据《公路通行能力手册》确定交织类型与交织区车辆速度等关键参数,计算出交织区长度与饱和度,并对交织区长度和服务水平进行检验,提出苜蓿叶立交集散车道连续入出口最小间距推荐值.利用VisSim软件构建连续入出口路段的交通仿真模型,以冲突率为安全性评价指标,对不同设计速度组合下最小间距推荐值的仿真冲突率进行评价.结果表明,推荐的入出口最小间距安全水平为安全、较安全和临界安全,故间距推荐值合理.研究成果可为苜蓿叶立交集散车道的连续入出口设计提供参考,完善相关规范与设计细则. 2022年05月16 00:00 2022年第3期 305 313 693663 潘兵宏,刘娟,柴虎,李翔,张冉阳 电加热水体温度场均匀性的仿真与实验 /oa/darticle.aspx?type=view&id=202203010 针对水平封闭圆管内水的电加热方式温度场不均匀问题,采用Fluent软件分别对水平圆管的轴向和径向温度场进行数值仿真.基于位式控制的分段分组加热方式在长度为1.8 m,直径为103 mm,外径为133 m的水平圆管上进行了实验验证.结果表明,圆管非水平放置会令加热后圆管的轴向温度场不均匀;在升温阶段,全壁面均匀加热的方式会使圆管温度在竖直径向出现显著的上高下低的温度分层现象;而只对圆管下半壁面加热可使圆管上层和下层温度差值从[&gt;8 ℃]降至 [&lt;1 ℃],有效提高了圆管温度场的均匀性;在稳态阶段,分段分组加热方式受位式控制的影响,径向温度偏差升到[1.6 ℃]以内.对比全壁面均匀加热的方式,分组加热方式特别是4组加热方式,在达到稳态的时间和稳态时的温度场均匀性仍具有明显优势.研究结果为实现高精度、无超调、温度场均匀性好的水平等压封闭圆管加热方案设计提供了参考. 2022年05月16 00:00 2022年第3期 314 323 3943159 李雄军,伍铭威,万浪辉,伍金杰,张怀宇 基于3D-nnUnet的三维超声胎肺容积自动测量 /oa/darticle.aspx?type=view&id=202203011 胎肺发育不良常在胎儿出生时引发严重的呼吸窘迫,甚至造成新生儿死亡.胎肺容积测量是临床上无创评估肺成熟度的一项重要手段,但现有的胎肺容积测量方法不仅误差大,繁琐耗时且临床实用性差.本研究基于3D-nnUnet首次提出一种高效稳定的胎肺自动分割和测量方法,利用网络对胎肺数据的自适应,有效克服图像组织对比度低和边缘模糊问题,实现了三维超声胎肺的精确分割.此外,针对胎肺超声图像在不同孕周差异大、样本数分布极不均衡的问题,提出利用HMEP(hard-mining and easy-penalized)损失来提升模型的泛化能力和稳定性.与二维最优分割网络DeepLab V3+和3D-Unet分割结果相比,基于3D-nnUnet的分割网络性能最佳,分割准确率高达85.7%;HMEP Loss能够使3D-nnUnet模型专注地学习少数困难样本,将分割准确率提升近2%;分割模型在不同孕周的数据上所测得胎肺容积和医生手动勾画的胎肺容积经一致性检验无显著的统计学差异.实验结果表明:该方法可高效实现三维超声胎肺的自动精确分割和容积测量,具有良好的稳定性和泛化能力,可避免以往胎肺容积测量方法繁琐耗时、误差较大的问题,在诊断胎肺发育状况及评估肺成熟度方面有较好的应用前景. 2022年05月16 00:00 2022年第3期 324 333 4361311 王琳,曹艳,邓子微,胡炯通,梁嘉敏,曹晓焱,潘文雄,严玉玲,孙志伟,杨鑫,倪东 基于前馈径向基网络的动态抓取参数估计方法 /oa/darticle.aspx?type=view&id=202203012 针对机器人抓取非匀速、随机方向运动的机动物体的过程中手眼信息不同步问题,提出一种基于径向基函数神经网络预测的物体运动参数估计方法.该方法采用核相关滤波(kernel correlation filter, KCF)算法实时跟踪目标位置并建立目标的运动模型,再通过前馈感知机和径向基神经网络分别预测目标的运动参数,并动态调整卡尔曼滤波运动估计方程的采样时间,大幅降低了计算耗时,提高了机器人抓取目标运动中参数估计的准确性.在UR5机器人抓捕平面自由移动的物体上进行实验,结果表明,所提出方法与前馈感知机网络相比,既将手爪与目标在追捕过程中最大落后距离减少了一半,又将抓取所需的时间减少了20%.该方法能较好地解决机器人抓捕过程中目标速度或方向突变引发的动态自适应问题. 2022年05月16 00:00 2022年第3期 334 342 2871624 王建强,黄开启,苏建华 记忆推理的放射源抓取机器人运动规划 /oa/darticle.aspx?type=view&id=202203013 针对机器人抓取铅罐内部放射源时,因铅罐的半封闭和强辐射环境导致机器视觉难以应用于放射源抓取的问题,提出一种记忆推理的强化学习抓取方法.基于机器视觉构建智能机器人抓取系统运动学模型,采用力觉反馈实现智能机器人与铅罐内部环境的交互,通过对历史抓取数据的记忆推理决策,实现对放射源的自主抓取.在机器人操作系统中使用Gazebo仿真器,分别采用蒙特卡罗采样法和基于记忆推理的强化学习抓取方法进行仿真.结果表明,基于记忆推理的强化学习抓取方法的平均抓取效率比蒙特卡罗采样法高84.67%,能高效地解决铅罐内部放射源的自主抓取问题. 2022年05月16 00:00 2022年第3期 343 348 815449 南文虎<sup>1</sup>, 徐付民<sup>1</sup>, 叶伯生<sup>2</sup> 基于BERT-BiLSTM模型的短文本自动评分系统 /oa/darticle.aspx?type=view&id=202203014 针对短文本自动评分中存在的特征稀疏、一词多义及上下文关联信息少等问题,提出一种基于BERT-BiLSTM(bidirectional encoder representations from transformers - bidirectional long short-term memory)的短文本自动评分模型.使用BERT(bidirectional encoder representations from transformers)语言模型预训练大规模语料库习得通用语言的语义特征,通过预训练好的BERT语言模型预微调下游具体任务的短文本数据集习得短文本的语义特征和关键词特定含义,再通过BiLSTM(bidirectional long short-term memory)捕获深层次上下文关联信息,最后将获得的特征向量输入Softmax回归模型进行自动评分.实验结果表明,对比CNN(convolutional neural networks)、CharCNN(character-level CNN)、LSTM(long short-term memory)和BERT等基准模型,基于BERT-BiLSTM的短文本自动评分模型所获的二次加权kappa系数平均值最优. 2022年05月16 00:00 2022年第3期 349 354 527496 夏林中, 叶剑锋, 罗德安, 管明祥, 刘俊, 曹雪梅 基于观测点机制的异常点检测算法 /oa/darticle.aspx?type=view&id=202203015 异常点检测是数据挖掘领域的一个重要研究方向,传统的基于近邻和局部异常因子的异常点检测算法存在计算复杂度高和误检率高的缺陷.为解决该缺陷,提出一种基于观测点机制的异常点检测(observation-point mechanism-based outlier detection, OPOD)算法.首先在原始样本空间中随机放置若干观测点,然后计算观测点与样本点之间的距离,将原始数据转换为与观测点相对应的距离数据,再估计距离数据的概率密度函数,进而计算距离数据出现的概率值,最后通过对多个观测点距离数据概率值的融合最终确定原始样本点中的异常点.基于PyCharm平台,采用sklearn.datasets的make_blobs函数生成仿真数据集,分别测试不同规模和不同维度数据集对OPOD算法性能的影响,并对比了OPOD算法、基于局部异常因子的异常点检测(local outlier factor-based outlier detection, LOFOD)算法和基于近邻的异常点检测(nearest neighbor-based outlier detection, NNOD)算法的运行时间、异常点召回率和误检率.结果表明,OPOD算法具有对异常点进行检测的能力,且随着观测点数量的增加算法呈收敛趋势;观测点选取合适的条件下,具有比基于近邻和局部异常因子的异常点检测算法更低的时间复杂度和更好的异常点检测效果. 2022年05月16 00:00 2022年第3期 355 362 646506 于万国<sup>1</sup>, 何玉林<sup>2, 3</sup>, 覃荟霖<sup>2</sup>